Passage (German, Paperback)

Die Entwicklung und Einf hrung von Next-Generation Sequencing-Technologien ver ndern die M glichkeiten f r Transkriptomstudien immens. Mit der Leistungsf higkeit der momentanen Sequenziertechnologien k nnen Millionen von Sequenzen in k rzester Zeit sequenziert werden. Mit PASSAGE wird in diesem Buch ein Verfahren zur genomweiten Genexpressionsanalyse ohne ein Referenzgenom vorgestellt. Neben der Analyse von Einzelzellen wird aufgezeigt wie mit PASSAGE auch die Analyse von Metatranskriptomen m glich ist. Ist ein Referenzgenom vorhanden so kann mit PASSAGE der Aufwand der Betrachtung der einzelnen Sequenzen mit eben diesem Verfahren deutlich reduziert werden. Neben der reinen Analyse der Daten wird zudem eine grafische Benutzeroberfl che zur Visualisierung der Ergebnisse vorgestellt. Damit wird dem Anwender eine u erst effiziente Analyse der Daten erm glicht. Der Vergleich mit Microarray-Ergebnissen zeigt die Validit t dieses Verfahrens zur genomweiten Genexpressionsanalyse an Einzelzellen oder von Metatranskriptomen.